Genomická platforma GD scan disponuje rovněž nejrůznějším technickým 

a materiálním vybavením:

  • technologie pro genotypování - Golden Gate 96, 384, 768 a 1536 SNPs
  • technologie pro genotypování - Golden Gate Bovine Net Merit Panel, bovinní čip 3K
  • technologie pro genotypování Infinium od 3072 do 1 milionu SNP markerů
  • technologie pro genotypování Infinium od 10 tisíc do  5 milionů SNP markerů dle jednotlivých druhů zvířat
    • skot: 6K, 54K, 800K SNP
    • prasata: 62K SNP 
  • technologie pro sekvenování Ion Torrent od Life Technologies (více než 100 milionů nukleotidových bází DNA a, ještě před koncem roku 2011, až 1 bilion bází)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 

 

Dále jsou využívány pipetovací stroje (pro izolaci DNA), vybavení genobank (skladování vzorků a biologických dat prostřednictvím softwarového programu LIMS), platforma qPCR pro klasické genotypování méně než 10ti markerů, pro vývoj diagnostických kitů týkajících se zdraví zvířat a pro realizaci transkripčních analýz.


Velkým úspěchem naší platformy byla i expertíza provedená na základě tzv. "Next generation sequencing" v oblasti biomedicínského výzkumu E.coli O157,   která způsobila intoxikaci více než 12ti osob na severu Francie v červenci 2011. Tato analýza genomu E.coli byla díky vynikající spolupráci CHRU v Lille, Pasteurova Institutu v Lile a Genes Diffusion provedena za méně než 3 dny.

 

Více si můžete přečíst zde: